У меня есть гражданский стаж почти 15 лет и выслуга с боевыми — 17 лет. В 32 года был уволен подполковником из-за несоблюдения контракта, но не по моей вине. Тогда шел 2001 год. Пришел недавно в Пенсионный фонд и военкомат с просьбой расчета мне пенс

Вы не учли один момент, а именно причину увольнения. Несмотря на то, что смешанного стажа вам вполне хватает для начисления пенсии, основание для увольнения не подходит. Отсюда и возник отказ, который не оспаривается. Придется ждать положенного возраста для выхода на пенсию.